秋季小龙虾的捕捞基本结束，开始进行亲本强化、虾苗繁育，水稻进入晒田和收割期。因此，秋季养殖管理对“稻虾共作”模式来说至关重要，应强化种虾培育，营造良好的环境，提高虾苗孵化率，促进其快速健康生长，才能确保来年取得大丰收。

　　一、强化投饵。　秋季是小龙虾的繁殖季节，要加强投喂高蛋白饵料，增强小龙虾亲虾体能，促进交配、排卵、孵化。实行“四定”投饵原则，科学投喂，保证龙虾吃好、吃饱，促进增膘增肥、快速生长。

　　二、及时清除杂害。　彻底清理虾苗繁殖田块的野杂鱼及老鼠、蛇等，虾苗没有出来前可用普通清杂的药品，虾苗出来后可用茶籽饼、茶粕精等。对于繁养分离的养殖塘需进行清塘，可亩用50公斤左右的生石灰或10公斤左右的漂白粉清理沟底。

　　三、加强水位管理。　根据小龙虾生长需要，结合季节变化，做好水位管理。9～11月浅水，保持田面水深20～30厘米，期间及时放水晒田并收割水稻，比普通水稻田晒田时间提前3～5天，放水尽量慢一点，放到平台位置要停几天。种虾不足的田块，晒田前应投放足量种虾。稻谷收割后第一时间进行注水，确保亲本虾尽早出洞孵化，水位以保持田面水深20～30厘米为宜。

　　四、肥水培藻。　秋季正值小龙虾幼虾生长发育期，培肥水质可以为幼虾提供充足的适口饵料，促进其生长发育。

　　五、适时栽种水草。　稻虾沟中水草的好坏将直接影响小龙虾的产量、规格和效益。冬季是小龙虾亲本穴居的时候，而刚孵化出的幼虾又没有夹草的能力，正是水草生长的黄金时间，应抓住此阶段进行补草种草。栽草品种以伊乐藻、轮叶黑藻、菹草和黄丝草为主。

　　六、水稻收割。　对于繁殖虾苗的田块，稻茬要尽量留高，收割后根据时间需要确定上水时间，可晒两天就上水。对于养殖成虾的田块，稻茬尽量留短，稻草收集起来用于冬季培肥水质。